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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Biblioteca Rui Tendinha. |
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Data corrente: |
13/01/2015 |
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Data da última atualização: |
13/01/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MARRACCINI, P.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; RAMOS, H. J. O.; ELBELT, S.; VIEIRA, N. G.; CARNEIRO, F. A.; SUJII, P. S.; ALEKCEVETCH, J. C.; SILVA, V. A.; DaMATTA, F. M.; FERRÃO, M. A. G.; LEROY, T.; POT, D.; VIEIRA, L. G. E.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C. |
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Afiliação: |
Maria Amélia Gava Ferrão, Incaper/Embrapa Café. |
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Título: |
Differentially expressed genes and proteins upon drought acclimation in tolerant and sensitive genotypes of Coffea canephora. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Experimental Botany, Oxford v. 63, n. 11, p. 4191-4212, 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this study was to investigate the molecular mechanisms underlying drought acclimation in coffee plants by the identification of candidate genes (CGs) using different approaches. The first approach used the data generated during the Brazilian Coffee expressed sequence tag (EST) project to select 13 CGs by an in silico analysis (electronic northern). The second approach was based on screening macroarrays spotted with plasmid DNA (coffee ESTs) with separate hybridizations using leaf cDNA probes from drought-tolerant and susceptible clones of Coffea canephora var. Conilon, grown under different water regimes. This allowed the isolation of seven additional CGs. The third approach used two-dimensional gel electrophoresis to identify proteins displaying differential accumulation in leaves of drought-tolerant and susceptible clones of C. canephora. Six of them were characterized by MALDI-TOF-MS/MS (matrix-assisted laser desorption-time of flight-tandem mass spectrometry) and the corresponding proteins were identified. Finally, additional CGs were selected from the literature, and quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) was performed to analyse the expression of all identified CGs. Altogether, >40 genes presenting differential gene expression during drought acclimation were identified, some of them showing different expression profiles between drought-tolerant and susceptible clones. Based on the obtained results, it can be concluded that factors involved a complex network of responses probably involving the abscisic signalling pathway and nitric oxide are major molecular determinants that might explain the better efficiency in controlling stomata closure and transpiration displayed by drought-tolerant clones of C. canephora. MenosThe aim of this study was to investigate the molecular mechanisms underlying drought acclimation in coffee plants by the identification of candidate genes (CGs) using different approaches. The first approach used the data generated during the Brazilian Coffee expressed sequence tag (EST) project to select 13 CGs by an in silico analysis (electronic northern). The second approach was based on screening macroarrays spotted with plasmid DNA (coffee ESTs) with separate hybridizations using leaf cDNA probes from drought-tolerant and susceptible clones of Coffea canephora var. Conilon, grown under different water regimes. This allowed the isolation of seven additional CGs. The third approach used two-dimensional gel electrophoresis to identify proteins displaying differential accumulation in leaves of drought-tolerant and susceptible clones of C. canephora. Six of them were characterized by MALDI-TOF-MS/MS (matrix-assisted laser desorption-time of flight-tandem mass spectrometry) and the corresponding proteins were identified. Finally, additional CGs were selected from the literature, and quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) was performed to analyse the expression of all identified CGs. Altogether, >40 genes presenting differential gene expression during drought acclimation were identified, some of them showing different expression profiles between drought-tolerant and susceptible clones. Based on the obtained results, it can be concluded that factors involved a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Candidate gene; Coffea canephora; Differential expression; Drought acclimation; Genética; Proteomic; Proteômica; Real time PCR. |
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Thesagro: |
Café; Coffea canephora; Genetics. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Biblioteca Rui Tendinha (BRT) |
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Biblioteca |
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Registro |
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| Registros recuperados : 16 | |
| 1. |  | CORREIA, L. Z.; RODRIGUES, G. A. de S.; SILVA, F. R. N. e; CERRI NETO, B.; ARANTES, L. de O.; DOUSSEAU, S. Efeitos de diferentes temperaturas na germinação de espécies de piperaceae. International Journal of Development Research, v. 10, n. 10, p. 41125-41129, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 2. | | TAVARES, E. T.; TATAGIBA, J. da S.; MARTINS, N. F.; SILVA, F. R.; MARINHO, V. L. A.; VENTURA, J. A.; ZAMBOLIM, E. M.; SOUZA JÚNIOR, M. T. Decodificando o genoma do vírus da "meleira". FITOPATOLOGIA BRASILEIRA, Fortaleza, v.28, n. Supl., p.253-254, 2003. CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 36., 2003, Uberlândia. Manejo integrado de doenças de plantas: resumos expandidos. Uberlândia: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2003. Resumo.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 3. | | MARRACCINI, P.; RAMOS, H.; VIEIRA, L. G. E.; FERRÃO, M. A. G.; SILVA, F. R. da; TAQUITA, J. A.; BLOCH JÚNIOR, C.; ANDRADE, A. C. Study of drought-tolerance mechanisms in coffee plants by an integrated analysis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas, Brazil. Programme abstracts. Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2008. Também publicado como resumo.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 4. | | SILVA, F. R. N. e.; CORREIA, L. Z.; SANT'ANA, C.; SOUZA, G. A. R. de.; COSTA, R. J.; FERREIRA, T. R.; CERRI NETO, B.; POSSE, S. C. P.; DOUSSEAU, S.; CRASQUE, J.; SANTOS, M. F. dos.; ARAUJO, E. L. Influência do tempo de prateleira dos frutos em câmara fria e do tipo de embalagem na qualidade fisiológica de sementes de mamão. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 7. , Vitória, ES. Produção e sustentabilidade hídrica. Anais... [recurso eletrônico] / organizador, David dos Santos Martins. Vitória, ES : Incaper, 2018.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 5. | | SILVA, F. R. N.; POSSE, S. C. P.; SOUZA, G. A. R.; CORREIA, L. S.; VERDIN FILHO, A. C.; VOLPI, P. S.; COMÉRIO, M.; DOUSSEAU, S.; JAM FILHO; ARANTES, L. de O.; POSSE, R. P. Avaliação da germinação de sementes de café conilon em diferentes ciclos de maturação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISAS CAFEEIRAS, 44., 2018, Franca, SP. Nosso café, melhorado desde o pé: anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2018.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 6. | | MARRACCINI, P.; SILVA, V. A. da.; ELBELT, S.; GUIMARÃES, B. L. S.; LOUREIRO, M. E.; DAMATTA, F. M.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; SILVA, F. R. da.; ANDRADE, A. C. Análise da expressão de genes candidatos para a tolerância à seca em folhas de clones de Coffea canephora var. Conillon, caracterizados fisiologicamente. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. 5p.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 7. | | SILVA, F. R.N.; POSSE, S. C. P.; SOUZA, G. A. R.; CORREIA, L. S.; VERDIN FILHO, A. C.; VOLPI, P. S.; DOUSSEAU, S.; FILHO, J. A. M.; ARANTES, L. de O.; POSSE, R. P. Qualidade fisiológica de sementes de café conilon de ciclo precoce submetidos à dessecação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISAS CAFEEIRAS, 44., 2018, Franca, SP. Nosso café, melhorado desde o pé: anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2018.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 8. | | SOUZA, G. A. R. de.; COSTA, R. J.; FERREIRA, T. R.; SILVA, F. R. N. e.; CORREIA, L. Z.; CLARISA, SANT'ANA; CERRI NETO, B.; POSSE, S. C. P.; DOUSSEAU, S.; NUNES, J. R.; SCALZER, A. P.; OLIVEIRA, D. C. Qualidade fisiológica de sementes de mamão 'Rubi INCAPER 511' em função do período de maturação dos frutos e do tipo de embalagem. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 7. , Vitória, ES. Produção e sustentabilidade hídrica. Anais... [recurso eletrônico] / organizador, David dos Santos Martins. Vitória, ES : Incaper, 2018.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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| 9. | | CERRI NETO, B.; SILVA, F.R.N.; FERREIRA, T.R.; CRASQUE, J.; ARANTES, L. de O.; MACHADO FILHO, J. A.; SOUZA, T. C. de; FALQUETO, A. R .; DOUSSEAU, S. Responses of wild Piper species to drought and rehydration cycles considering stomatal closure as a marker of the alarm phase. PHOTOSYNTHETICA, v. 61, n. 3, p. 363-376, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
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| 10. | | SOUZA, G. A. R. de; SILVA, F. R. N. e; COSTA, R. J.; FERREIRA, T. R.; SILVA, J. F. da.; CORREIA, L. Z.; LIMA, K. C. C.; SANT'ANA, C.; DOUSSEAU, S.; ARANTES, L. de O.; SANTANA, E. N. de.; SCALZER, A. P. Acidificação de frutos de mamão em solução de ácido acético e sua influência sobre ps caracteres físico-químicos dos frutos. In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 22.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE PÓS GRADUAÇÃO, 18.; ENCONTRO NACIONAL DE INICIAÇÃO À DOCÊNCIA, 8., 2017, Urbanova .Patrimônio e Cultura Desafios da Ciência Frente a Identidades Plurais. São José dos Campos: UNIVAP, 2018.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 11. | | SOUZA, G. A. R. de; PIRES, I. D.; CERRI NETO, B.; COSTA, R. J.; CORREIA, L. Z.; FERREIRA, T. R.; LIMA, K. C. C.; SILVA, F. R. N. e; MACHADO FILHO, J. A.; DOUSSEAU, S.; FALQUETO, A. R.; ARANTES, L. de O. Caracterização fotoquímica de clones de Coffea canephora Pierre ex Froehner cultivados em condições de pleno sol. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2019.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 12. | | COSTA, J. C.; CORREIA, L. Z.; SILVA, J. F. da.; LIMA, K. C. C.; SANT'ANA, C.; SILVA, F. R. N. e.; SOUZA, G. A. R. de.; FERREIRA, T. R.; OLIVEIRA, D. C.; ARANTES, L. de O.; DOUSSEAU, S.; SANTANA, E. N. de. Influência do ácido acético na manutenção da qualidade do fruto de mamão 'golden' pós-colheita. In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 22.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE PÓS GRADUAÇÃO, 18.; ENCONTRO NACIONAL DE INICIAÇÃO À DOCÊNCIA, 8., 2017, Urbanova .Patrimônio e Cultura Desafios da Ciência Frente a Identidades Plurais. São José dos Campos: UNIVAP, 2018. 5 p.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 13. | | RUAS, K. F.; MACHADO FILHO, J. A.; SILVA, F. R. N. e.; COSTA, R. J.; CERRI NETO, B.; RODRIGUES, W. P.; BERNADO, W. de P.; ABREU, D. P. de.; PAIXÃO, J. S.; DOUSSEAU, S.; SOUZA, G. A. R. de.; CAMPOSTRINI, E. Estresse hídrico em Carica papaya L.: trocas gasosas e crescimento. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 7. , Vitória, ES. Produção e sustentabilidade hídrica. Anais... [recurso eletrônico] / organizador, David dos Santos Martins. Vitória, ES : Incaper, 2018.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 14. | | COSTA, R. J.; FERREIRA, T. R.; SILVA, F. R. e.; SOUZA, G. A. R. de.; CERRI NETO, B.; LEITE, L. de A.; SANTOS, C. A. F.; OLIVEIRA, D. C.; ARANTES, L. de O.; MACHADO FILHO, J. A.; DOUSSEAU, S.; SOUZA, C. A. S. Fluorescência transiente da clorofila a em plantas de theobroma cacao submetidas a diferentes períodos de alagamento. In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 22.; ENCONTRO LATINO AMERICANO DE PÓS GRADUAÇÃO, 18.; ENCONTRO NACIONAL DE INICIAÇÃO À DOCÊNCIA, 8., 2017, Urbanova .Patrimônio e Cultura Desafios da Ciência Frente a Identidades Plurais. São José dos Campos: UNIVAP, 2018. 4 p.| Tipo: Publicação em Anais de Congresso |
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| 15. | | MARRACCINI, P.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; RAMOS, H. J. O.; ELBELT, S.; VIEIRA, N. G.; CARNEIRO, F. A.; SUJII, P. S.; ALEKCEVETCH, J. C.; SILVA, V. A.; DaMATTA, F. M.; FERRÃO, M. A. G.; LEROY, T.; POT, D.; VIEIRA, L. G. E.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C. Differentially expressed genes and proteins upon drought acclimation in tolerant and sensitive genotypes of Coffea canephora. Journal of Experimental Botany, Oxford v. 63, n. 11, p. 4191-4212, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 16. | | ANDRADE, A. C.; SILVA, V. A.; VINECKY, F.; BARBOSA, E. A.; SILVA, F. R. da; LOUREIRO, M. E.; MATTA, F. M. da; MARRACINI, P.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da.; FERRÃO, R. G.; MELO, J. A. T.; SILVA, L. P.; BLOCH JR, C. Identification and functional characterization of genes involved in drought stress responses in coffee plants. In: International Conference on Coffee Science, 2006, Montpellier. Programme, abstracts... Lausane: Association Scientifique Internationale du Café, 2006.| Biblioteca(s): Biblioteca Rui Tendinha. |
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